سریال "پزشک دربار" داستان زندگی دختری سخت کوش و با استعداد به نام "تان یون شیان" است که علم پزشکی را از اجدادش به ارث برده، اما به خاطر این که حکومت زنان را از فعالیت در حوزه پزشکی، فراگیری علم پزشکی و طبابت منع می کند، تصمیم می گیرد مخفیانه در رشته پزشکی تجربه کسب کند. او با علاقه زیاد به علم پزشکی سعی دارد بر تمام موانع و مشکلات بر سر راهش غلبه کند، اما همه چیز آن جایی سخت می شود که با شخص امپراطور دیدار می کند و...